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Documentation logiciels calcul et bureautique

Publié le 2 juin 2008, mis a jour le 23 avril 2020

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Documentations du CCuB

Configuration de NX NoMachine

Utilisations des logiciels : choisir la version d’un logiciel et obtenir de l’aide

Visualisation graphique haute performance avec TurboVNC et VirtualGL

Introduction à Grid Engine (logiciel de batch)

Ancien mode emploi du cluster

Copier des données sur le cluster de calcul (mode déconnecté)


Services proposés

Services proposés

Historique


Langages de programmation et calcul parallèle

Fortran Fortran, CernLib, ACML
Calcul parallèle MPI et OpenMP
Java
Perl
Python
Prolog

Mode d’emploi : Compiler vos codes en Fortran, C/C++


Calcul scientifique, Elements finis

Matlab
Scilab
Castem Méthode F.E.M. du CEA
Comsol Femlab
Abaqus
Isight

Analyse de données, statistiques

Sas
R R Project for Statistical Computing

Calcul formel

Maple
Reduce
Sage
OpenAxiom

Chimie, méthodes ab-initio

Gaussian (et Gaussview 3.0) Modèlisation de systèmes moléculaires
Jaguar Ab-Initio Electronic Structure Package
Gamess General Atomic and Molecular Electronic Structure System
VASP Vienna Ab-Initio Simulation Package
Gromacs GROningen MAchine for Chemical Simulations
Quantum Espresso Electronic-structure calculations and materials modeling at the nanoscale
NwchemA chemistry software package which also includes quantum chemical and molecular dynamics functionality

Graphisme

Amira / Avizo
Ovito
VMD
Xfig postscript-Xfig
Povray
OpenGL
PgPlot
XmGrace
GNUPlot
Matlab
Fiji Fiji is Just ImageJ

Climatologie

GRADS traitement cartographique
Ferret visualisation pour océanographes et météorologues
MM5 modele de climatologie
Netcdf traitement de données sous forme de tableau
Pyclimate outil pour l’analyse de varaibilités climatiques
NCO netcdf operators
Ncar Ncar
NCL NCL
Arpege-climat Arpege-climat
WRF Weather Research and Forecasting
WRF Chimere

Bureautique - editeur de texte

LaTeX traitement de texte scientifique
OpenOffice logiciel de bureautique Open Source
Pdftk manipulation de fichiers pdf
Gvim
Nedit
emacs

Génétique

Migrate-n1 Migrate-n1
Structure Structure

Divers

Benchmarks linpack et specbenchs

 


Date de création: septembre 1994
Contact : ccub@u-bourgogne.fr
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